
在印度發(fā)現(xiàn)的B.1.617變異株傳播速度多快?疫苗還有效嗎?
原文作者:David Adam
B.1.617變異株的傳播速度有多快?能否免疫逃逸?會(huì)如何影響疫情走向?這些都是亟待解答的關(guān)鍵問(wèn)題。
自去年末首次在印度發(fā)現(xiàn)后,新冠病毒變異株B.1.617已經(jīng)擴(kuò)散到包括美國(guó)、新加坡、英國(guó)在內(nèi)的幾十個(gè)國(guó)家,并在這些國(guó)家的部分地區(qū)成為了主要流行株。
英國(guó)博爾頓發(fā)現(xiàn)了B.1.617.2變異株感染病例,圖為博爾頓的一條街道。來(lái)源:Hollie Adams/Bloomberg/Getty
目前,研究人員已經(jīng)鑒定出該變異株的三種亞型:B.1.617.1(即“最早的”B.1.617)、B.1.617.2、B.1.617.3,每個(gè)亞型的遺傳組成稍有不同。
研究人員正全力以赴研究這些變異株,努力搞清楚它們會(huì)如何在它們已經(jīng)“立足”的國(guó)家左右疫情發(fā)展。一些關(guān)鍵問(wèn)題仍有待回答,比如這些變異株的傳播速度有多快,它們的免疫逃逸潛力如何,以及它們是否能導(dǎo)致更嚴(yán)重的病情。
這些研究很多都會(huì)以標(biāo)準(zhǔn)流行病學(xué)的形式開(kāi)展——通過(guò)檢測(cè)確診感染、找出感染的變異株,以及將這些數(shù)據(jù)與患者的臨床癥狀和疫苗接種狀況進(jìn)行交叉對(duì)照。研究人員還能從基因組測(cè)序數(shù)據(jù)中獲得重要信息,確定B.1.617亞型中有哪些突變,并將這些突變與行為已被我們了解的之前變異株的突變進(jìn)行比較。
傳染性更強(qiáng)
“我會(huì)研究單個(gè)突變,因?yàn)槊恳粋€(gè)突變都有我們認(rèn)為會(huì)增加傳染性的特性。”英國(guó)萊斯特皇家醫(yī)院顧問(wèn)病毒學(xué)家Julian Tang說(shuō)。傳染性是衡量變異株人際傳播速度的指標(biāo),傳染性增加或?qū)⒅埔咔椋o醫(yī)療衛(wèi)生系統(tǒng)和疫苗接種等防疫工作帶來(lái)更大壓力。比如B.1.617.2變異株攜帶了名為452R和478K的突變,Tang認(rèn)為這兩種突變都與傳染性增加有關(guān)。這兩種突變都能改變新冠病毒用來(lái)入侵人類(lèi)細(xì)胞的刺突蛋白。
研究人員還能快速追蹤B.1.617.2的傳播情況,因?yàn)樗幕蚪M攜帶了主要流行株B.1.1.7缺少的一個(gè)標(biāo)志物。這個(gè)標(biāo)志物被稱(chēng)為S基因靶點(diǎn)(S gene target),用于診斷感染的PCR檢測(cè)的部分結(jié)果會(huì)顯示這個(gè)標(biāo)志物是否存在,因此,陽(yáng)性S靶點(diǎn)可作為一個(gè)替代指標(biāo),在無(wú)需對(duì)樣本進(jìn)行完全測(cè)序的情況下快速了解B.1.617.2的傳播情況。S基因檢測(cè)以及對(duì)英國(guó)病毒樣本更加詳細(xì)的測(cè)序數(shù)據(jù)顯示,B.1.617.2打敗了B.1.617的其他兩個(gè)亞型,有取代B.1.1.7 之勢(shì),成為推動(dòng)英國(guó)新一波疫情的最常見(jiàn)流行株——B.1.1.7是2020年末在英國(guó)東南部發(fā)現(xiàn)的一種變異株。
“我們預(yù)計(jì)眼下在整個(gè)英國(guó),半數(shù)感染都來(lái)自B.1.617.2變異株。”正在追蹤感染人數(shù)的比利時(shí)天主教魯汶大學(xué)生物學(xué)家Tom Wenseleers說(shuō)。他在網(wǎng)上分享的一項(xiàng)對(duì)英國(guó)測(cè)序數(shù)據(jù)的分析顯示,B.1.617.2感染病例每天的增加速度可能比B.1.1.7還快13%。
5月12日發(fā)表的一份報(bào)告中,科學(xué)大流行病流感建模小組操作分組(Scientific Pandemic Influenza Group on Modelling, Operational subgroup)這個(gè)英國(guó)政府咨詢(xún)委員會(huì)表示,根據(jù)現(xiàn)有數(shù)據(jù),B.1.617.2的傳染性比B.1.1.7強(qiáng)50%。
“傳染性強(qiáng)50%的預(yù)測(cè)聽(tīng)起來(lái)完全可信,”英國(guó)劍橋大學(xué)微生物學(xué)家、英國(guó)COVID-19基因組學(xué)英國(guó)聯(lián)盟負(fù)責(zé)人Sharon Peacock說(shuō),“我認(rèn)為隨著數(shù)據(jù)的增加,我們會(huì)更加肯定,但你也不能忽略實(shí)際發(fā)生的情況。”
Peacock解釋道,目前而言,B.1.617.2的激增并沒(méi)有讓英國(guó)病例總數(shù)大幅增加——仍比該國(guó)1月的最近一次高峰要低很多。不一樣的是,人們現(xiàn)在感染的是新變異株,而不是B.1.1.7。“我們現(xiàn)在看到的是譜系的更迭。”她說(shuō)。
倫敦的一個(gè)新冠病毒檢測(cè)點(diǎn)。研究人員正在利用PCR檢測(cè)結(jié)果追蹤B.1.617變異株的傳播情況。來(lái)源:Hollie Adams/Bloomberg/Getty
免疫逃逸
研究人員很想知道的另一個(gè)問(wèn)題是:疫苗對(duì)B.1.617變異株是否依然有效。如果這些變異株中有毒株能逃逸人體從疫苗或之前病毒暴露中獲得的免疫保護(hù),它們就有引發(fā)新一波感染的潛力,從而打亂解除封鎖等限制措施的計(jì)劃。
英國(guó)已有一半人口打過(guò)至少一劑新冠疫苗,理論上說(shuō),B.1.617.2在英國(guó)的傳播速度加快可能預(yù)示著它能逃逸疫苗保護(hù)。但Wenseleers表示,基本沒(méi)有證據(jù)證明疫苗逃逸在推升感染人數(shù)。博爾頓是英國(guó)西北部的一個(gè)疫情熱點(diǎn)地區(qū),來(lái)自博爾頓5月中旬的初步數(shù)據(jù)顯示,當(dāng)?shù)匾蚋腥綛.1.617.2住院的大部分患者都沒(méi)打過(guò)疫苗。在對(duì)該變異株檢測(cè)呈陽(yáng)性的18名住院患者中,約5人打過(guò)一劑疫苗,只有1人打過(guò)兩劑疫苗。
Wenseleers分析的其他數(shù)據(jù)也顯示,英國(guó)西北部的B.1.617.2感染病例一開(kāi)始聚集在并未常規(guī)接種疫苗的青少年群體,之后傳播到了30、40歲的人群中,而在50歲人群中的感染率較低——這個(gè)人群接種完兩劑疫苗的可能性更高。“這讓人松了口氣。”他說(shuō)。
基因測(cè)序數(shù)據(jù)顯示,B.1.617.2的快速傳播不太會(huì)像B.1.617.1的傳播一樣,對(duì)疫苗接種工作構(gòu)成影響。Tang說(shuō),B.1.617.2中鑒定出的452R和478K突變都和傳染性增加以及疫苗逃逸有關(guān)。但B.1.617.1 還攜帶另一個(gè)名為484Q的突變,這個(gè)突變與疫苗逃逸的相關(guān)性更強(qiáng)[1]。而B(niǎo).1.617.2中沒(méi)有發(fā)現(xiàn)這個(gè)突變。
讓人安心的是,B.1.617變異株亞型中沒(méi)有發(fā)現(xiàn)與病情加重有關(guān)的突變,Tang說(shuō)。
研究人員還能在實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)抗體中和不同病毒變異株的能力。《自然-醫(yī)學(xué)》[2]5月17日發(fā)表的一項(xiàng)研究顯示,這類(lèi)檢測(cè)對(duì)于現(xiàn)實(shí)世界免疫保護(hù)具有“很好的預(yù)測(cè)性”。一些實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)表明,疫苗對(duì)B.1.617.1亞型的效力可能會(huì)下降[1]。對(duì)B.1.617.2的類(lèi)似實(shí)驗(yàn)結(jié)果尚未發(fā)表,但英國(guó)公共衛(wèi)生部5月23日發(fā)布的數(shù)據(jù)顯示,兩劑輝瑞-BioNTech和牛津-阿斯利康疫苗都對(duì)B.1.617.2有效。
模擬未來(lái)傳播
一些關(guān)鍵問(wèn)題仍沒(méi)有答案,包括B.1.617.2的傳染性比其他變異株強(qiáng)了多少——比如已經(jīng)在英國(guó)等國(guó)家形成傳播鏈的B.1.1.7變異株。“有可能強(qiáng)了50%,但也有可能強(qiáng)10%或60-70%。”倫敦大學(xué)學(xué)院醫(yī)療衛(wèi)生研究員Christina Pagel說(shuō)。有了具體的答案,研究人員就能構(gòu)建出更準(zhǔn)確的模型,了解這些變異株會(huì)在它們流行的國(guó)家如何影響疫情發(fā)展,包括英國(guó)。“這將極大地改變今年夏天可能出現(xiàn)的情況。”P(pán)agel說(shuō)。“20%到50%的差距就像一場(chǎng)溫和的疫情和1月出現(xiàn)的那種高峰之間的差距。所以我們真的要把這個(gè)數(shù)字確定下來(lái)。”
Pagel還想知道關(guān)于疫苗有效性的結(jié)果是否能讓人放心。“光說(shuō)疫苗‘有效’沒(méi)什么用,因?yàn)橛行У姆秶軓V。”她說(shuō)。疫苗效力試驗(yàn)主要關(guān)注疫苗防重癥和防死亡的能力。但她認(rèn)為,我們還要知道打過(guò)疫苗的人是否會(huì)在感染 B.1.617.2后不發(fā)病,然后傳給別人。如果是這樣的話(huà),“你就無(wú)法達(dá)到本來(lái)可以達(dá)到的群體免疫水平了。”
Peacock表示,繼續(xù)從英國(guó)疫情中收集流行病學(xué)數(shù)據(jù)將幫助回答以上問(wèn)題,還有助于預(yù)測(cè)B.1.617變異株在其他國(guó)家的潛在影響,尤其是在還無(wú)法獲得大量疫苗的發(fā)展中國(guó)家。“很重要的是,我們可以通過(guò)統(tǒng)計(jì)這些數(shù)據(jù)為全球社會(huì)盡一份力。”她說(shuō)。
參考文獻(xiàn)
[1] Collier, D. A. et al. Nature https://doi.org/10.1038/s41586-021-03412-7 (2021).
[2]Khoury, D. S. et al. Nature Med. https://doi.org/10.1038/s41591-021-01377-8 (2021).
原文以What scientists know about new, fast-spreading coronavirus variants為標(biāo)題發(fā)表在2021年5月24日的《自然》的新聞版塊上
? naturedoi:10.1038/d41586-021-01390-4
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